中國科學(xué)院上海免疫與感染研究所（以下簡稱研究所）原名中國科學(xué)院上海巴斯德研究所，成立于2004年10月11日，是中國科學(xué)院直屬事業(yè)單位。?
研究所致力于重大感染性和傳染性疾病基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究，創(chuàng)新發(fā)展病原學(xué)、免疫學(xué)和疫苗學(xué)理論，突破未知病原檢測和疾病免疫防治等關(guān)鍵核心技術(shù)，推動新發(fā)再發(fā)傳染病研究國際合作，為全球公共健康提供創(chuàng)新理論、策略和解決方案。主要科研方向有： ???? ?
重要病原與宿主互作的機(jī)理及應(yīng)對策略：圍繞呼吸道、消化道、體液、媒介等途徑傳播的重要病原，闡明病原致病性、宿主易感性以及免疫應(yīng)答的分子生物學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)基礎(chǔ)，揭示病原在宿主體內(nèi)建立急、慢性感染的關(guān)鍵機(jī)理,?探索感染預(yù)防和臨床干預(yù)的措施。???? ?
重要病原發(fā)現(xiàn)、溯源及傳播機(jī)制：圍繞病原發(fā)現(xiàn)、監(jiān)測、預(yù)警中的關(guān)鍵科學(xué)問題，開展病原分離、鑒定、溯源、進(jìn)化與跨種傳播機(jī)制的研究，支撐重大傳染病的全球監(jiān)測與預(yù)警。 ???? ?
傳染病防治技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)品研發(fā)：聚焦傳染病防治藥物研發(fā)、疫苗創(chuàng)制、免疫診治的前沿技術(shù)，重點創(chuàng)新抗體藥物和新型疫苗研發(fā)及制備技術(shù)；建立疫苗和抗體研發(fā)及評估的實驗平臺，完善防治技術(shù)與產(chǎn)品創(chuàng)新鏈。?
傳染病與人體微生物組：研究全生命周期中，人體共生微生物與宿主的共進(jìn)化規(guī)律和調(diào)節(jié)宿主生理、病理的機(jī)制，揭示人體共生微生物在病原感染與致病過程中的微生態(tài)影響，及其在免疫響應(yīng)中的作用，并發(fā)展相應(yīng)的檢測診斷技術(shù)和干預(yù)策略。 ???? ?
研究所設(shè)有中國科學(xué)院分子病毒與免疫重點實驗室，微生物、發(fā)育與健康研究中心等學(xué)術(shù)單元。截至2024年5月31日，有研究組30個。設(shè)有生物學(xué)博士后流動站1個。設(shè)有生物學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)2個專業(yè)一級學(xué)科博士和碩士研究生培養(yǎng)點。???? ?
截至2023年12月31日，研究所共有在職職工及博士后160人。其中正高級專業(yè)技術(shù)崗位28人，副高級專業(yè)技術(shù)崗位20人；在學(xué)研究生232人，其中中國科學(xué)院大學(xué)學(xué)籍189人（博士101人、碩士88人），聯(lián)培生43人。??? ?
研究所支撐部門即科技基礎(chǔ)部，內(nèi)設(shè)綜合管理辦公室、科技基礎(chǔ)支撐中心、生物安全辦公室、生物安全政策研究中心。行政管理部門包括黨政辦公室（行政辦公室、黨委辦公室、紀(jì)監(jiān)審辦公室、國際合作辦公室合署辦公）、科技發(fā)展與合作處、人力資源處（含研究生工作辦公室）、財務(wù)處。 ???? ???
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