中國科學(xué)院上海巴斯德研究所、中科院生物安全大科學(xué)中心上海分部崔杰研究組成員魏小曼、李祥等根據(jù)目前發(fā)表的新型冠狀病毒（2019-nCoV）分析結(jié)果及公共數(shù)據(jù)庫里上傳的基因組比對結(jié)果，進行綜合分析，推測出此次暴發(fā)的新型冠狀病毒的早期進化機制，為新型冠狀病毒感染肺炎疫情防控提供科學(xué)依據(jù)。研究成果以觀點形式于2020年1月29日在線發(fā)表在《國家科學(xué)評論》（National Science Review）。

2019-nCoV不同于以往任何一種已知的HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1和MERS-CoV等六種能夠感染人類的冠狀病毒，屬于第七種能夠感染人類的冠狀病毒，并且能引起肺炎。對2019-nCoV進行基因組學(xué)分析，結(jié)果顯示其與SARS、MERS病毒皆有較大的區(qū)別，基因組差異度分別21%和50%。盡管同屬于Beta冠狀病毒，2019-nCoV與SARS、MERS冠狀病毒卻并不相同，可以認(rèn)為是SARS冠狀病毒的遠(yuǎn)親，而絕非SARS冠狀病毒的變種或SARS復(fù)燃。

研究指出，在冠狀病毒和宿主長期共存的情況下，病毒通常會因為宿主限制而在同一物種例如蝙蝠中流行，但是少數(shù)情況下，不同病毒通過感染同一宿主細(xì)胞后會發(fā)生重組，從而產(chǎn)生一系列遺傳物質(zhì)不同的重組體，這些新重組的病毒中有些具備感染新宿主（其它動物或者人類）的能力。從現(xiàn)有數(shù)據(jù)來看，新型冠狀病毒在早期進化中顯示較弱的感染力，也可在人與人之間傳播，但傳播能力不容忽視。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示病毒缺少拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)，聚類不明顯。但是針對2019-nCoV的分析發(fā)現(xiàn)在不同的蛋白上至少有17個位點涉及氨基酸的改變，而其中幾種突變在一起廣東家庭聚集性病例中比較常見。這表明，病毒在發(fā)生人與人之間傳播后開始產(chǎn)生突變。

至于病毒有沒有發(fā)生適應(yīng)性進化，目前還無法定論，需要更多的病毒基因組分析及后續(xù)針對突變位點的功能實驗驗證。研究人員未來將集中分析病毒在自然界及人群中的進化模式，闡明2019-nCoV的起源及與中間宿主作用的進化機制。研究人員同時呼吁，嚴(yán)密監(jiān)控病毒的突變、進化及傳播，這對指導(dǎo)疫情的控制十分必要。

論文鏈接： Wei et al., 2020. Evolutionary Perspectives on Novel Coronaviruses Identified in Pneumonia Cases in China. National Science Review. (https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa009)