5月6日，國(guó)際重要學(xué)術(shù)期刊《中國(guó)科學(xué)：生命科學(xué)》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所崔杰研究組題為“Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity”的最新研究成果。 

　　海洋蘊(yùn)藏著豐富的資源，具有極大的開發(fā)潛力；但海洋生物安全問(wèn)題同樣需要引起更高的重視。海洋中不僅有著許多尚未被發(fā)現(xiàn)的動(dòng)、植物物種，還有著數(shù)量更為龐大、種類繁多的微生物。傳統(tǒng)的海洋病毒研究多集中在噬菌體為代表的DNA病毒上，對(duì)多樣性高、基因組不穩(wěn)定的RNA病毒的遺傳多樣性、分布特征以及傳播模式等均不清楚。 

　　無(wú)脊椎動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組中病毒的病毒分布和多樣性：上方的柱狀圖展示了每個(gè)文庫(kù)中的PE reads數(shù)目，不同顏色代表著不同的樣品采集地點(diǎn)：東海——紅色，黃海——黃色，南海——藍(lán)色，每個(gè)文庫(kù)的名稱和宿主的分類在柱狀圖的頂部展示。下方的柱狀圖展示了每個(gè)文庫(kù)中發(fā)現(xiàn)的病毒種類和數(shù)量。 

　　崔杰團(tuán)隊(duì)從不同海域共采集了3門6綱58種的海洋無(wú)脊椎動(dòng)物樣品，并利用宏轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序方法對(duì)不同物種的RNA病毒組進(jìn)行研究。該團(tuán)隊(duì)使用改進(jìn)的生物信息分析方法，鑒定出了涵蓋9個(gè)病毒家族（Durnavirales、Totiviridae、Bunyavirales、Chuviridae、Picornavirales、Flaviviridae、Hepelivirales、Solemoviridae、Tombusviridae）的363個(gè)RNA病毒，其中的315個(gè)與已知的RNA病毒相似度較低，被認(rèn)為是全新的RNA病毒。該團(tuán)隊(duì)報(bào)道了3個(gè)海洋無(wú)脊椎動(dòng)物漢坦樣病毒，其較陸地漢坦病毒更為古老，進(jìn)一步支持了漢坦病毒具有海洋起源的可能。結(jié)合基因組結(jié)構(gòu)和統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，該團(tuán)隊(duì)展示了豐富的海洋病毒遺傳多樣性和病毒基因組可塑性，揭示了不同海域間、不同宿主類別間可能存在的病毒傳播現(xiàn)象。整體而言，該研究通過(guò)解析海洋無(wú)脊椎動(dòng)物RNA病毒組，描繪病毒生態(tài)圈，為海洋RNA病毒的起源、進(jìn)化、傳播提供了重要見(jiàn)解。 

　　病毒跨宿主傳播速率與病毒數(shù)目的相關(guān)性：橫坐標(biāo)反映了病毒的數(shù)量，縱坐標(biāo)反映了病毒跨宿主傳播事件的頻率，連線和灰色區(qū)域代表了線性回歸分析的擬合曲線以及95%的置信區(qū)間。 

　　碩士研究生張譽(yù)譯和科研助理陳毅聰為本文的共同第一作者，崔杰研究員為本文的通訊作者。該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)科學(xué)院分子病毒與免疫重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等項(xiàng)目的資助。 

　　文章鏈接：http://engine.scichina.com/doi/10.1007/s11427-020-1936-2