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科研進(jìn)展

Nature Communications | 陳昌斌研究組合作揭示克服“超級(jí)真菌”耳念珠菌耐藥新靶點(diǎn)

發(fā)表日期: 2025-05-25

5月20日,中國科學(xué)院上海免疫與感染研究所陳昌斌研究組聯(lián)合南昌大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院黃孝天研究組、軍事醫(yī)學(xué)研究院病原微生物生物安全國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室周冬生研究組,在國際期刊?Nature Communications?在線發(fā)表了題為“Targeting epigenetic regulators to overcome drug resistance in the emerging human fungal pathogen?Candida auris”的研究論文。該研究通過深入探究組蛋白H3翻譯后修飾調(diào)控因子與“超級(jí)真菌”耳念珠菌的耐藥性及致病性之間的關(guān)系,揭示了組蛋白H3乙酰轉(zhuǎn)移酶Gcn5在調(diào)控耳念珠菌耐藥性和致病性中的關(guān)鍵作用,提出了Gcn5特異性抑制劑CPTH2與棘白菌素類藥物卡泊芬凈聯(lián)用方案,為臨床上應(yīng)對耳念珠菌耐藥問題提供了新的解決策略。

自2009年首次被發(fā)現(xiàn)以來,耳念珠菌已蔓延至全球六大洲40余個(gè)國家的醫(yī)療機(jī)構(gòu),其引發(fā)的院內(nèi)感染在重癥監(jiān)護(hù)病房(ICU)中表現(xiàn)出高度的傳播性和耐藥性。新冠疫情大流行期間,包括美國、德國、印度和墨西哥等多個(gè)國家均報(bào)道了耳念珠菌在ICU病房爆發(fā)感染的事件。該病原體對主要抗真菌藥物(如氟康唑)的耐藥率超過90%,并且在藥物脅迫下能夠迅速獲得新的耐藥性,使得治療變得極為困難,侵襲性感染的病死率最高可達(dá)70%。更嚴(yán)峻的是,其強(qiáng)大的環(huán)境耐受性可使病菌在醫(yī)療設(shè)備表面持續(xù)存活,常規(guī)消毒手段難以徹底清除,顯著增加了醫(yī)院交叉感染的風(fēng)險(xiǎn)。世界衛(wèi)生組織(WHO)在2022年發(fā)布的首份真菌重點(diǎn)病原體清單中,將其列為最高風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)。

組蛋白翻譯后修飾作為表觀遺傳調(diào)控的核心機(jī)制,在腫瘤治療領(lǐng)域已展現(xiàn)出巨大潛力。近年研究發(fā)現(xiàn),組蛋白乙酰化、甲基化等修飾不僅調(diào)控腫瘤細(xì)胞的增殖與轉(zhuǎn)移,更為開發(fā)靶向表觀遺傳酶的抗癌藥物(如HDAC抑制劑)提供了理論基礎(chǔ)。這種通過調(diào)控表觀遺傳機(jī)制干預(yù)疾病進(jìn)程的策略,為抗感染研究提供了重要啟示。組蛋白翻譯后修飾是否可用于病原真菌感染治療,目前尚缺乏相關(guān)研究報(bào)道。

基于此,本研究團(tuán)隊(duì)通過系統(tǒng)解析組蛋白H3翻譯后修飾調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(重點(diǎn)分析了乙酰轉(zhuǎn)移酶Gcn5和Rtt109,以及甲基轉(zhuǎn)移酶Set1、Set2和Dot1的功能),首次發(fā)現(xiàn)乙酰轉(zhuǎn)移酶Gcn5在耳念珠菌耐藥性調(diào)控中的核心作用。為進(jìn)一步揭示Gcn5調(diào)控耳念珠菌耐藥性的分子機(jī)制,研究團(tuán)隊(duì)綜合運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組分析、染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)等多種實(shí)驗(yàn)技術(shù),發(fā)現(xiàn)Gcn5通過介導(dǎo)組蛋白H3乙酰化修飾,直接調(diào)控麥角固醇生物合成關(guān)鍵基因(如ERG11)以及藥物外排相關(guān)基因(如CDR1和MDR1)的表達(dá),從而增強(qiáng)耳念珠菌對唑類抗真菌藥物的耐藥性。進(jìn)一步研究還發(fā)現(xiàn),Gcn5可通過直接調(diào)控鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶信號(hào)通路及轉(zhuǎn)錄因子Cas5,影響細(xì)胞壁完整性及其對棘白菌素類藥物的耐藥性。在感染模型中,缺失Gcn5亦顯著降低了耳念珠菌的致病能力。

為驗(yàn)證Gcn5作為抗耳念珠菌感染藥物靶點(diǎn)的可行性,研究團(tuán)隊(duì)采用特異性抑制劑CPTH?,靶向阻斷Gcn5介導(dǎo)的組蛋白H3乙酰化功能。結(jié)果顯示,CPTH?與棘白菌素類藥物卡泊芬凈聯(lián)合使用展現(xiàn)出顯著的協(xié)同抗菌效果,且對人類細(xì)胞和小鼠均無明顯毒性。

圖1. Gcn5特異性抑制劑CPTH2與卡泊芬凈聯(lián)用展現(xiàn)顯著協(xié)同殺菌效應(yīng)

圖2. CPTH2小鼠體內(nèi)安全性評估顯示良好生物相容性

本研究首次揭示了Gcn5在耳念珠菌耐藥性與致病性中的核心作用,提出了一種通過靶向表觀遺傳調(diào)控因子以克服真菌耐藥性的全新治療策略。鑒于耳念珠菌在全球范圍內(nèi)的快速傳播及對現(xiàn)有抗真菌治療手段的高度抗性,未來有針對性地對CPTH2進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化或開發(fā)更高效的Gcn5特異性抑制劑,有望為臨床應(yīng)對多重耐藥耳念珠菌感染提供全新的解決方案。

原文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41467-025-59898-6

【研究團(tuán)隊(duì)】

本研究由中國科學(xué)院上海免疫與感染研究所陳昌斌研究員擔(dān)任通訊作者,南昌大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院黃孝天教授與軍事醫(yī)學(xué)研究院病原微生物生物安全國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室周冬生研究員擔(dān)任共同通訊作者。中國科學(xué)院上海免疫與感染研究所助理研究員張雨萍、南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院主任技師曾令兵為本研究的共同第一作者。

本研究得到了以下項(xiàng)目的支持:科技部重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目(2022YFC2304700),國家自然科學(xué)基金(32170195,32311530119,32060040,32460049,32300167,32470200),上海市科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃2023“基礎(chǔ)研究專項(xiàng)”(23JC1404201),上海“一帶一路”聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目(22490750200),江西省科技創(chuàng)新高層次人才項(xiàng)目“江西省雙千人才計(jì)劃”(jxsq2023201019),國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2022YFC2303504),以及江蘇省基礎(chǔ)研究項(xiàng)目自然科學(xué)基金(BK20231511)。

【研究組簡介】

病原真菌感染及宿主免疫研究組(組長:陳昌斌研究員)

研究方向涵蓋基礎(chǔ)研究與臨床轉(zhuǎn)化兩大領(lǐng)域:

基礎(chǔ)研究:致力于揭示人類致病真菌的共生與感染機(jī)制、毒力基因的調(diào)控機(jī)制以及宿主的抗真菌免疫應(yīng)答,力求為真菌感染的預(yù)防與治療提供理論依據(jù),探索新的抗真菌藥物靶點(diǎn)。主要研究內(nèi)容包括:

(1)白色念珠菌共生-致病轉(zhuǎn)變的信號(hào)通路;

(2)真菌效應(yīng)因子與宿主免疫系統(tǒng)的相互作用;

(3)真菌突破血腦屏障的分子機(jī)制;

(4)腸道與生殖道菌群對真菌感染及宿主免疫的影響;

(5)新型抗真菌藥物篩選與作用機(jī)制研究;

(6)真菌耐藥的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制。

臨床轉(zhuǎn)化研究:臨床重大傳染性疾病的防治,如微生物耐藥、器官移植過程中的共感染、真菌引發(fā)的婦科疾病、皮膚感染、腦膜炎及敗血癥等,利用宏基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組及代謝組學(xué)技術(shù),結(jié)合動(dòng)物模型,開發(fā)病原檢測新技術(shù)并篩選抗感染先導(dǎo)藥物。

近年來,研究團(tuán)隊(duì)已在 Cancer Cell、Cell Host & Microbe、Nature Communications、Cell Reports、eLife、PLOS Pathogens 等國際知名期刊發(fā)表系列研究成果。歡迎對病原真菌感染與宿主免疫研究感興趣的優(yōu)秀學(xué)生和博士后加入研究團(tuán)隊(duì)(聯(lián)系方式:cbchen@ips.ac.cn)。


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